Saat ini, terdapat beberapa tantangan yang mendasari perlunya dilakukan pendataan dan pemutakhiran data Penghayat Kepercayaan, antara lain:

• Sebagian penghayat kepercayaan masih belum mencantumkan atau menampilkan identitas kepercayaannya secara terbuka, meskipun hak-hak mereka telah dijamin dan dilindungi oleh peraturan perundang-undangan yang berlaku. 
• Istilah "Kejawen" kurang tepat digunakan untuk menyebut penghayat kepercayaan, karena "Kejawen" merupakan istilah yang merujuk pada sifat atau corak budaya Jawa, bukan identitas suatu aliran kepercayaan. Oleh karena itu, penyebutan sebaiknya disesuaikan dengan nama organisasi atau aliran kepercayaan yang bersangkutan. 
• Perubahan Data Keanggotaan dan Kepengurusan: Terjadi perubahan jumlah anggota, kepengurusan, maupun domisili penghayat yang belum tercatat secara berkala.
• Validitas Data Komunitas: Masih terdapat komunitas atau organisasi penghayat yang memerlukan verifikasi keberadaan dan aktivitasnya di lapangan.
• Kebutuhan Basis Data Kebudayaan: Diperlukan data yang akurat dan mutakhir untuk mendukung pelestarian nilai budaya, tradisi, dan kearifan lokal yang dijaga oleh para penghayat kepercayaan.

Kegiatan pendataan ini bukan sekadar rutinitas administratif, melainkan upaya untuk:

• Validasi Faktual: Memastikan keberadaan penghayat kepercayaan, komunitas, dan organisasi yang masih aktif.
• Integrasi Data: Menyelaraskan dan memperbarui data penghayat kepercayaan dalam basis data kebudayaan daerah.
• Dasar Perencanaan Program: Menyediakan data yang kredibel bagi pemerintah daerah dalam merancang program pembinaan, fasilitasi, pelestarian budaya, serta pemberdayaan komunitas penghayat kepercayaan.

Kegiatan pendataan dan pemutakhiran data Penghayat Kepercayaan ini bertujuan untuk:

• Memutakhirkan database Penghayat Kepercayaan agar sesuai dengan kondisi dan perkembangan terkini di lapangan.
• Mendokumentasikan profil, keanggotaan, dan aktivitas komunitas Penghayat Kepercayaan sebagai bagian dari pelestarian warisan budaya tak benda.
• Memverifikasi keberadaan serta keaktifan organisasi atau paguyuban Penghayat Kepercayaan guna mendukung pembinaan dan penguatan kelembagaan.
• Menyediakan data yang akurat dan terintegrasi sebagai dasar perencanaan program pelestarian, pemberdayaan, dan fasilitasi Penghayat Kepercayaan oleh pemerintah daerah.
• Memetakan persebaran Penghayat Kepercayaan di wilayah daerah guna mendukung penyusunan kebijakan kebudayaan yang tepat sasaran.